复仇者联盟以及随后影响深远的纽约之战，让外星人和超能力者不再是坊间传说的秘密。纽约之战过后，世界格局即将重新洗牌，野心家们则蠢蠢欲动，神盾局面临前所未有的挑战。在此危急关头，一度传闻死于纽约的特工菲尔·科尔森探员（克拉克·格雷格 Clark Gregg 饰）“复活”，吸纳了身怀绝技的格兰特•沃德（布雷特·道顿 Brett Dalton 饰）、梅琳达·梅（温明娜 Ming-Na Wen 饰）、莱奥·菲兹（伊恩·德·卡兹泰克 Iain De Caestecker 饰）、盖玛·西蒙斯（伊丽莎白·亨斯屈奇 Elizabeth Henstridge 饰）以及来自黑客构成的民间团体涨潮组织的斯凯（科洛·本内特 Chloe Bennet 饰）加入进来。
　　他们以一己凡人之力，投入到各种匪夷所思且疑云重重的危险事件的调查中去……

　　故事讲述一名精明能干的FBI特工Audrey Parker (Emily Rose 扮演)因执行公差来到缅因州(美国东北角的州)一所名为“Haven”的小镇上，来到小镇不久自己惊奇发现这个小镇被一种神秘的力量保护着使得这里人们把这里当成避难所并且他们也受到一种超自然力量 的影响，当又惊奇的发现当地的市民用一种类似睡眠的能力来传递信息后......

　　故事紧接上一季结尾，Kiera阻止了Liber8组织发动的恐怖袭击，但事情却远不止这么简单。当本季开始之时，市长被大胆的刺客刺杀，已经消失了一段时间的Kiera不得不再次出现，与Carlos联手调查这起案件。与此同时，Kiera尝试与Alec重新取得联系并缓解他们之间的紧张关系，但是Alec在读过未来自己所留的信息之后已经完全变了一个人。

　　该剧由J.J. Abrams挂名制片，《危机边缘》（Fringe）制片人J.H. Wyman监制，Bad Robot公司出品。该剧被描述为一部「动作戏和兄弟情为主的警匪剧」，故事发生在距今35年之后的近未来时代。此时拥有高度人工智能的人形机器人已经出现，所有的洛杉矶警署侦探都分配了一名人形机器人搭档。他们既要调查与人类有关的案件，也要调查与机器人有关的案件。但在许多情况下，人类案件和机器人案件是混杂在一起的。
　　2048年，人类社会已经进化到一个新的高度。
　　来见见John Kennex（Karl Urban）——一起有史以来最恐怖的针对警察部门的袭击事件中的幸存者。在昏迷了17个月之后，他终于醒来，但对当时发生的事情却记忆模糊。他的搭档在那次事件中不幸丧生，他的女友Anna Moore（Mekia Cox）已经离他而去。他失去了一条腿，医生给他安上一条高度精巧的人造仿生腿。
　　John情绪低落，精神萎靡，严重的创伤后强迫综合症和应激障碍症不停折磨着他，而且他对自己身上的「仿生部件」充满排斥感。尽管如此，他还是在警队队长Sandra Malconado（Lili Taylor）的请求下返回了工作岗位。Sandra是他相识最久也最忠诚的一个朋友，他知道她绝不会害他。
　　根据上级的命令，现在每一个警察都必须与一名机器人组成搭档。尽管John对机器人强烈厌恶，但还是被安排了一名机器搭档——刚刚下线准备投入战斗的MX-43型机器战警。当这位机器同事发现John隐藏着某种犯罪证据后，John毫不留情地「终结」了他（相关情节参考预告片）。于是实验室技术员Rudy Lom（Mackenzie Crook）给他介绍了一位新的机器同伴：Dorian（Michael Ealy）。因为Dorian产生了出人意料的「情感反应」，警队停止了他执行任务的资格，将他召回实验室进行仔细检查。尽管这些「情感反应」看起来只不过是Dorian中枢系统出了错误，但正是这些「错误」让John对Dorian产生了共鸣。毕竟，John现在是「部分机器人」，而Dorian是「部分人类」。John和Dorian的相互理解不仅让他们在工作中形成互补，而且在某种程度上将他们「联系」在一起。
　　在适应新搭档的同时，John还必须学会与新同事相处——其中包括急于成名的Valerie Stahl侦探（Minka Kelly）和总是疑神疑鬼的Richard Paul侦探（Michael Irby）。Richard坚称John该为当年那次导致多名警官殉职的灾难性任务负责，他当然不欢迎John重新加入警队。
　　该剧是一部单元元素和连续元素并存的剧集（近年来几乎所有的J.J. Abrams挂名剧集都如此）——John和Dorian每集都将在充满未来色彩的都市中处理特定的案件，但当年那起事件的真相对John来说始终是个谜，John围绕这起神秘事件展开的调查及与之相关的故事将推动主线剧情的发展。
　　该剧的其他制片人大多来自《危机边缘》剧组，多数编剧也是Bad Robot公司的「御用编剧」（参与了《危机边缘》、《疑犯追踪》、《革命》等剧的创作）。J.J. Abrams曾在一次访谈中称该剧具有《银翼杀手》的味道。

　　故事发生在一个名为切斯特磨坊的小镇上，一个从天而降且不可摧毁的“穹顶”断绝了小镇和外界的一切联系，同时也终结了小镇维持多年的平静假象。很快，小镇居民们便看清了他们如今已成“瓮中之鳖”的现实，而随着资源的不断消耗，混乱不可避免的发生了。在老警长意外去世后，维持小镇治安的重 担落到了年轻的副警长琳达（娜塔丽·马丁内兹 Natalie Martinez 饰）肩上，而议员大吉姆（迪恩·诺里斯 Dean Norris 饰）则从中看到了成为“统治者”的大好机会。
　　一些奇怪的症状出现在了磨坊镇的四个孩子们的身上，在树林里，他们发现了一个小型的穹顶并且成为了它的保护者，因为穹顶似乎在向他们传达某一些讯息。当犯罪和危险的气息在小镇上渐渐弥漫开来之时，越来越多的迹象显示，穹顶选择磨坊镇，这并不是一个巧合。

　　和上一季相同，本季的《黑镜》也由3个故事组成，向观众展现了一个残酷而又现实的未来世界。
　　《马上回来》：一次车祸夺走了玛莎（海莉·阿特维尔 Hayley Atwell 饰）的男友艾什（多姆纳尔·格利森 Domhnall Gleeson 饰）的生命。在朋友的推荐下，玛莎利用艾什在社交网络上留下的信息塑造了一个具有人工智能的假艾什。刚开始玛莎只能通过手机听到合成的艾什的声音，不久之后，那个声音告诉玛莎，有一个方法可以让艾什“真正”的回到她的身边。
　　《白熊》：托尼（勒诺拉·克里奇洛 Lenora Crichlow 饰）从昏迷中醒来，发现自己在一间陌生的房间里并且失去了记忆。在她昏迷的这段时间中，世界显然发生了翻天覆地的变化，街道上充斥着无情的看客，而她竟然成为了杀人狂追杀的猎物。
　　《沃尔多一刻》：沃尔多是一只虚拟的蓝熊，出现在深夜的喜剧节目中，而站在它背后的，是配音演员杰米（丹尼尔·里格比 Daniel Rigby 饰）。沃尔多极高的人气让节目组产生了以它的形象参加国会竞选，而杰米发现自己逐渐变成了被操控的傀儡。

　　Toby's personal life also heats up as his relationship grows with crime reporter Tia Tremblay, who is inexplicably the one person he can't read. Life will be no less dramatic for Toby's colleagues as Sgt. Michelle McCluskey struggles through a complicated marriage with her husband, while IIB head Alvin Klein  attempts to protect himself and his team from the political manoeuvrings of the ambitious new police superintendent, Nichola Martell. Meanwhile, new director of emergency services Oz Bey realizes that being the boss is harder than he expected.

　　第三季故事开始于第二独立团抵达查尔斯顿七个月后。在此期间，查尔斯顿被指定为「新美利坚合众国」的首都，Tom Mason被推选为政治领袖（相当于总统）。但他大多数时间不是待在办公室里处理政务，还是率领军队顽强抵抗外星入侵者的一次次进攻。与前任Manchester博士比起来，Tom在对待外星人的态度上更具侵略性也更主动。查尔斯顿政府与起义的「突击者」形成了不太牢靠的联盟关系，Tom让「突击者」起义军留在查尔斯顿与人类并肩作战，但这引发了一些人类的不满，两个种族的关系持续紧张。「突击者」起义军在战斗前总是将脸上涂满红黄相间的条纹，以纪念在第二季结尾英勇牺牲的领袖「红眼」。Tom的儿子Ben现在是查尔斯顿政府与「突击者」起义军之间的联络人。无论人类还是「突击者」都明白，他们即便联手也很难打败强大的敌人——此前被第二独立团戏称为「鱼头」的外星种族Espheni。虽然他们的君王已死，但另一个更强大、更邪恶的君王刚刚继承了统治权。更糟糕的是，一个全新的外星种族在双方激战正酣时抵达地球并迅速投身战场。